MAN Insan Cendekia Jambi adalah model satuan pendidikan jenjang menengah yang memadukan antara Pendidikan Agama Islam dengan bidang ilmu pengetahuan dan teknologi secara seimbang. Dengan keterpaduan tersebut, MAN Insan Cendekia Jambi diharapkan menjadi pelopor upaya menghilangkan dikotomi antara ilmu agama dengan ilmu pengetahuan dan teknologi. MAN Insan Cendekia Jambi menempatkan etika Islam yang bersumber pada nilai-nilai universal Alquran dan hadis untuk menjiwai seluruh bidang keilmuan yang diajarkan. Islam mengembangkan ilmu yang bersifat universal antara ilmu-ilmu qauliyyah, yaitu ilmu-ilmu yang berkaitan dengan teks keagamaan, seperti Alquran, Hadis, Akidah Akhlak, Fikih, dengan ilmu-ilmu kauniyah, yaitu sains dan ilmu-ilmu empiris-kemasyarakatan.
Pengkajian dan pendalaman keilmuan berangkat dari paradigma humanistik-etis dengan dukungan strategi yang terpadu. Ilmu-ilmu yang akan diajarkan di MAN Insan Cendekia Jambi, jika didasarkan pada nomenklatur keilmuan yang telah ada pada Standar Isi, terdiri atas ilmu humaniora (bahasa, sejarah umum dan kebudayaan Islam, demografi), ilmu sosial (sosiologi, ekonomi, geografi sosial), dan ilmu alam (Fisika, Kimia, Biologi, Geografi), yang kajian-kajiannya dipadukan dengan ilmu Alquran dan Hadis.
Pengkajiannya dilakukan secara collaborative, critical thinking, creativity, dan communicative (C4) sehingga dapat diinterpretasi secara terus-menerus seiring dengan perkembangan zaman. Nilai-nilai universal yang terkandung dalam Alquran dan Hadis menjadi pijakan dan pandangan hidup yang menyatu dalam satu tarikan napas keilmuan dan keagamaan yang diabdikan bagi kemaslahatan umat manusia. Keterpaduan keilmuan ini akan diwujudkan dan dikembangkan dalam pembelajaran di dalam ruang belajar dan/atau di lulusan MAN Insan Cendekia Jambi yang kuat akidah dan pengetahuan keagamaannya (tafaqquh fiddin), luas dan kritis pemikiran, serta moderat perilaku keagamaan, ditunjang dengan penguasaan kompetensi yang ditargetkan. Pada gilirannya, lulusan MAN Insan Cendekia Jambi dapat beradaptasi dan mampu belajar dengan baik di perguruan-perguruan tinggi terkemuka, baik di dalam maupun luar negeri, dan bermanfaat bagi kehidupan di masyarakat sehingga mampu meneguhkan dirinya sebagai sosok muslim yang rahmatan lil alamin.
Keunggulan MAN Insan Cendekia Jambi dibanding madrasah lainnya adalah: